治疗灰指甲的方法很多，可以外涂药，可以内服药，还可以外科手术拔除病甲。
手指甲和脚趾甲的生长速度是不同的，完全替换一个新的指甲，手指甲需要100天，而脚趾甲大约要300天，所以治疗灰指甲必须要有耐心。
（1）手术拔甲：适于单发的灰指甲，在局部麻醉下，将患甲拔除。这种方法创面大，出血，易引起感染。手术后一般会感觉较疼痛，容易重新感染复发，由于“治标不治本”，临床极少使用。而且心脏病、高血压、糖尿病等的患者，不宜手术治疗。
（2）内服药物：适于多个指（趾）甲同时患病者，此法在临床上早有应用，如特比萘芬片、灰黄霉素及酮康唑均有一定疗效，且方便。但因为这类药必须达到真菌所寄生的甲板处才能发挥抗菌作用，用药量大，用药时间长，有副作用，且停药后易复发，故不宜作为灰指甲的常规治疗药物。
（3）外用疗法：外用疗法较安全，一般无痛苦、无副作用，是治疗灰指甲的首选疗法。
根据药剂不同，主要有浸泡、局部涂药和封包削治等方法。
1、上药前，宜用白醋浸泡灰指甲，以起软化作用；
2、使用指甲锉（非专业人士切忌用刀片，以免出血感染其他疾病）将不规则坏甲磨薄，磨甲周期为2天一次为佳；
3、选用盐酸特比萘芬软膏、黄金甲指甲修护膏、酮康唑乳膏等外用药局部涂抹；
总之，治疗灰指甲要坚持不懈。同时还应积极治疗身体其他部位的癣病及慢性全身性疾病，提高自身抵抗力，防治并重，这样才有可能彻底治愈灰指甲。

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